جاء إنشاء مركز الوثائق والمخطوطات في الجامعة الأردنية تلبية لحاجة كان يستشعرها القائمون على هذه الجامعة منذ تأسيسها وفي عام 1972/ 1973م صدرت الإرادة الملكية السامية بإنشاء المركز وأصبح معلماً رائداً من معالم الجامعة التي تؤدي دورها في تشجيع البحث العلمي والعناية بالتراث وتهيئة المناخ السليم للدارسين ، وتولى المركز مهمة جمع الوثائق والمخطوطات وسجلات المحاكم الشرعية والأوقاف الإسلامية في بلاد الشام والصحف إضافة إلى جمع التقارير والخرائط والرحلات والروايات والملفات والمذكرات والصور وحفظها وتوثيقها حسب الأصول العلمية .
ضمن فلسفة المركز الهادفة إلى جمع الوثائق والمخطوطات والمطبوعات, ووضعها بين أيدي الدارسين والباحثين ، تم تشكيل مجلس للمركز يعرف بـ " مجلس المركز " يتألف من رئيس وعشرة أعضاء من المهتمين بالوثائق والمخطوطات على النحو التالي:
- الأستاذ الدكتور محمد عدنان البخيت / رئيساً.
- الأستاذ الدكتور علي محافظة / عضواً.
- الأستاذ الدكتور عميد البحث العلمي / عضواً.
- الأستاذ الدكتور عميد كلية الشريعة / عضواً.
- الأستاذ الدكتور عميد كلية الآداب / عضواً.
- الأستاذ الدكتور مدير مركز الوثائق والمخطوطات ودراسات بلاد الشام / عضواً.
- الأستاذ الدكتورة هند أبو الشعر / عضواً.
- الاستاذ الدكتور عميد كلية الآثار والسياحة / عضواً.
- عطوفة مدير عام التوجيه المعنوي / عضواً.
- الدكتورة مدير مكتبة الجامعة / عضواً.
- الاستاذ الدكتور مدير المكتبة الوطنية / عضواً.
كما يضم المركز لجنة علمية تم تشكيلها عام 1972/1973م تُعنى بدراسة تاريخ بلاد الشام من خلال إقامة مؤتمرات علمية دولية وإعداد ونشر دراسات علمية في مختلف الجوانب المتعلقة بتاريخ الأردن، فلسطين، سورية ولبنان في مختلف العصور من النواحي السياسة والتاريخية والثقافية والاقتصادية والمالية والمعمارية والاجتماعية، وقد صدر عنها ثلاثة وأربعون مجلداً باللغتين العربية والإنجليزية، وقد أنجزت اللجنة عقد تسعة مؤتمرات دولية بالتعاون ما بين الجامعة الأردنية وجامعة اليرموك وجامعة دمشق .