المكتبة: تضم مكتبة المركز مجموعة مهمة من المصادر والمراجع في مختلف جوانب الحضارة الإسلامية، كما تضم أيضاً فهارس المخطوطات الصادرة عن مختلف المؤسسات والهيئات المهتمة بالمخطوطات العربية، يضاف إلى ذلك الدراسات الحديثة التي تتناول بالبحث تاريخ البلاد العربية في عصورها المختلفة، وتتكون المكتبة من: 1. قاعة المطالعة وهي أيضاً قاعة المصادر والمراجع. 2. زاوية للكتب العربية والفارسية والعثمانية. 3. زاوية للكتب باللغات المختلفة. 4. قاعة لكتب الرحالة الذين زاروا البلاد العربية في فترات تاريخية متفاوتة. 5. عدد كبير من رسائل الدكتوراة المتعلقة بالتاريخ الإسلامي والمقدمة للجامعات الفرنسية والأمريكية. وتضم مكتبة المركز إضافة إلى ما ورد سابقاً بعض المكتبات والأوراق الخاصة بأعلام أردنيين قدمت هدية للمركز منها: 1. مكتبة وأوراق المرحوم مصطفى وهبي التل. 2. مكتبة وأوراق المرحوم فايز الغول. أما من حيث التجهيزات، فإن المركز مزود بعدد من قارئات الميكروفيلم لاستعمالها من قبل الدارسين والباحثين، إضافة إلى وجود وحدة تصوير كاملة تستعمل لأغراض المركز. ويسعد مركز الوثائق والمخطوطات في الجامعة الأردنية أن يرحب بجميع الباحثين والدارسين للإفادة من مقتنياته.